En caso de ausencia del presidente de la Corte de Justicia, la secuencia de reemplazo es la siguiente: primero, doctor Ángel Humberto Medina Palá; segundo, doctor Adolfo Caballero; tercero, doctor Juan Carlos Caballero Vidal; y cuarto, doctor José Abel Soria Vega.Se recuerda que el artículo 10 de la Ley Orgánica de Tribunales (Nº 5854) prevé que la presidencia de la Corte será desempeñada entre el uno de marzo al último día de febrero siguiente por uno de los cinco ministros que la integran. Por su parte, el artículo 11 de la misma ley, modificado por la Ley 6044, establece que la Corte, por decisión de la mayoría de sus miembros, determinará cada año la integración de las salas Primera y Segunda y quién ha de presidirlas.
