Las áreas protegidas de la provincia contienen gran parte de la diversidad biológica de la región, y custodian el patrimonio arqueológico y paleontológico provincial de enorme valor histórico, científico y paisajístico.San Juan es una de las provincias argentinas con mayor porcentaje de superficie bajo normas especiales de conservación. Además, cuenta con el privilegio de tener bajo protección territorios valorados y categorizados por organismos internacionales.